Разработка сорбента для аффинной хроматографии на основе пептидомиметиков
Работа победителя открытой городской научно-практической конференции «Наука для жизни» в секции «Органическая химия» среди работ учащихся 10−11 классов |
Направление работы: Органическая химия, Биотехнология, Методы очистки белковых препаратов
Авторы работы: ГБОУ Школа им. А. Боровика
Email: Написать
Предметы: Биология, Химия
Классы: 10 класс
Мероприятия: Открытая городская научно-практическая конференция «Наука для жизни» 2020 года
|
Актуальность
Персонализированная медицина – перспективный метод раковой терапии. Одно из её направлений – изучение метаболизма опухолевых клеток и использование её ферментов и рецепторов как терапевтической мишени. Рак предстательной железы – самое распространённое онкологическое заболевание среди мужчин на территории России, поэтому остро стоит вопрос о поиске новых методов его лечения. Заболевание сопровождается гиперэкспрессией Простат-специфического мембранного антигена (фермента Глутаматкарбоксипептидазы II), который и является маркером рака. Если выделить и очистить фермент, получив его высокоочищенный препарат, это позволит проводить анализы ex vivo при разработке лекарств, направленных на ингибирование метаболизма клеток раковой опухоли предстательной железы.
Цель
Разработка сорбента и метода иммобилизации пептидомиметика для аффинной хроматографии ферментов.
Задачи
- Разработать и провести серию модельных реакций для подтверждения или опровержения возможности модификации сорбента на основе моносахарида ПСМА-лигандом
- Осуществить сборку полноценного сорбента и оценить возможность его применения в аффинной хроматографии
Оснащение и оборудование, использованное при создании работы
- Роторный испаритель
- Мембранный насос
- Аналитические весы
- Пипетки автоматические
- Лампа УФ
- Вытяжной шкаф
- Ультразвуковая баня
- Насос пластинчато-роторный
- Ультразвуковой дезинтегратор
- ЯМР-спектрометр
- Хроматографическая колонка.
Описание
Целью автора было разработать аффинный сорбент. Обычно он имеет три компонента: матрицу, в этом случае – агарозный гель (полимерный углевод агароза в форме сфер, помещённых в буфер), спейсер (автор выбрал аминокапроновую кислоту) – это длинная молекула, которая обеспечивает доступность лиганда и сам лиганд (пептидомиметик ПСМА-лиганд), отвечающий за селективное взаимодействие сорбента и фермента.
Экспериментальная часть работы:
I. Модельные реакции
1. Моно-модификация галактозы эпихлоргидрином
В качестве первого фрагмента спейсера был выбран эпихлогидрин: гидроксильные группы галактозы были замещены оксирановыми циклами.
Реакция протекала при нагревании в тетрагидрофуране в присутствии водной щёлочи и межфазового катализатора тетрабутиламмоний бромида.
Для перевода остатков брома в соль NaBr в реакционную смесь ввели 40 %-ный раствор гидроксида натрия по массе.
2. Модификация галактозы остатком ε-аминокапроновой кислоты
Далее необходимо было удлинить спейсерную группу и ввести на периферию молекулы карбоксильную группу для дальнейшего присоединения ПСМА-лиганда путём создания пептидной связи. Катализатор трифлат кальция позволил ускорить эту реакцию.
3. Модификация галактозы ПСМА-лигандом
Заключительный этап модельных реакций и самая интересная часть практического модуля. Для модификации галактозы ПСМА-лигандом путём создания пептидной связи автор выбрал метод активированных эфиров. Реакция серьёзная, поэтому проводилась под чутким контролем научного руководителя. Самая главная задача – соблюсти порядок добавления реагентов, иначе не избежать большого количества побочных продуктов реакции.
По завершении каждого этапа модификации автор проверял структуру полученного вещества методом ЯМР-спектроскопии и очищал продукт реакции от примесей с помощью колоночной хроматографии. А за ходом самих реакций автор следил с помощью тонкослойной хроматографии.
На модели было показано, что модификация реализована, при этом возможно регулировать количество пришиваемых лигандов. Разработанная методика была успешно применена для сборки аффинного сорбента на основе агарозного геля. К сожалению, с учётом возможностей автора, судить об успешности модификации агарозного геля представлялось возможным только благодаря микроскопу: сферы поэтапно увеличивались в объёме, что косвенно подтверждает успешность синтеза.
Автор участвовал в постановке реакций, сборке и подготовке реакционных установок, снятии ЯМР-спектров. Очистка промежуточных соединений также проводилась автором.
Результаты работы/выводы
- Разработан и реализован модельный эксперимент по модификации углеводной составляющей (галактозы) пептидомиметиком ПСМА-лигандом
- Подобраны оптимальные условия очистки промежуточных соединений. Для синтезированных соединений с близкой хроматографической подвижностью оптимально использовать систему растворителей этилацетат/изопропиловый спирт/вода
- Проведена модификация агарозного геля согласно отработанной методике, получен аффинный сорбент для аффинной хроматографии фермента Глутаматкарбоксипептидазы II
Перспективы использования результатов работы
Предполагаются дальнейшие исследования зависимости структура/активность (работоспособности) полученного модифицированного сорбента методом иммуноферментного анализа. При наличии успешных результатов данного исследования разработанный сорбент можно будет применять в аффинной хроматографии для выделения фермента Глутаматкарбоксипептидазы II. Теоретически такие факторы, как размер частиц сорбента, пространственная доступность ПСМА-лиганда благодаря спейсеру и выбор оптимальной подвижной фазы способствуют хорошему связыванию сорбента с ферментом, а значит, выделению без повреждений и качественной очистке Глутаматкарбоксипептидазы II.
Сотрудничество с вузом/учреждением при создании работы
Работа выполнялась на базе Технопарка «Альтаир»
Награды/достижения
Конференция «Инженеры будущего» – призёр