В 2015 году ГБОУ Школа № 329 включено в проект Департамента образования города Москвы «Инженерный класс в московской школе». В рамках проекта школа сотрудничает с ФГБОУ ВПО «Московский государственный технический университет имени Н.Э. Баумана». Направление сотрудничества - прикладная математика.
Профильное образование в рамках проекта осуществляется по технологическому профилю (направленность – физика, математика, информатика).
Для развития инженерного мышления в 2016-2017 учебном году в рамках предметной области "Технология" образовательная программа школы в 1 классах включает курс "Лего-конструирование и моделирование", в 5 классах  – "Роботехника".
В рамках проекта учащимися и педагогами было посещено более 45 мероприятий, проводимых партнёрами проекта и более 15 мероприятий, проводимых образовательной организацией. Учащиеся школы успешно прошли летнюю научно-образовательную инженерную практику для учащихся инженерных классов образовательных организаций города Москвы и учащихся профильных образовательных организаций в МГТУ им. Н.Э. Баумана. Участие в инженерной практике предоставило возможность учащимся изучения современных инженерных технологий, знакомства с действующим лабораторным оборудованием с проведением наглядных демонстраций и опытов на практико-ориентированных занятиях. Все учащиеся получили сертификат МГТУ им. Н.Э. Баумана. За время реализации проекта в 2015-2016 учебном году были достигнуты следующие результаты: 
– 2 золотые медали в конкурсе «Молодые новаторы Москвы» в рамках ХIХ Московского международного салона изобретений и инновационных технологий «Архимед 2016»;
– 3 место в городском турнире «Изучи интернет – управляй им» (координационный центр доменов RU/РФ и проектный офис «Школа Новых Технологий»);
– школа-участник проекта «Сетевая лаборатория РоботоЛАБ» Ресурсного центра Робототехники Лаборатории интеллектуальных технологий ЛИНТЕХ, экспериментальная площадка ФГАУ «Федеральный институт развития образования» по роботехнике;
– 3 место в научно-практической конференция учащихся образовательных учреждений по робототехнике «РоботоБум – 2016»;
– дипломы 2 и 3 степени в открытой конференции научно- исследовательских работ и проектов «Циолковский-2016. Обучая будущему» в ГБОУ Школа-лицей 1420.
В системе дополнительного образования работают творческие объединения естественнонаучной направленности (предметные области "Математика", "Физика", "Информатика") и технической направленности ("ЛЕГО-конструирование и моделирование", "Роботехника", "Академия Cisco", "Школьная видеостудия "Фокус").
В 2016-2017 учебном году для прохождения производственной практики и ранней профориентации обучающихся школа заключила договор о сотрудничестве с Федеральным государственным унитарным предприятием "Мытищинский научно-исследовательский институт радиоизмерительных приборов".